Případ kolem dotací pro holding Agrofert se dostal do další významné fáze. Nejvyšší státní zastupitelství 17. srpna 2026 rozhodlo, že vyšetřování podezření souvisejících s dotacemi zůstane jako celek v působnosti Úřadu evropského veřejného žalobce (EPPO). Věc se tedy nebude dělit mezi evropské a české orgány.
Rozhodnutí se týká konkrétního kompetenčního sporu v této kauze. Neznamená, že by české orgány obecně ztratily pravomoc vyšetřovat dotační trestnou činnost. V tomto konkrétním případě však bude další prověřování pokračovat pod vedením EPPO.
Bitva o kompetence: Kdo bude případ vyšetřovat?
Případ se začal výrazněji rozvíjet v únoru 2026, kdy Česká pirátská strana podala trestní oznámení kvůli podezření souvisejícímu s možným střetem zájmů premiéra Andreje Babiše a s poskytováním dotací Agrofertu.
Babiš následně převedl akcie Agrofertu do svěřenského fondu RSVP Trust. Podle společnosti Agrofert se tak stalo 20. února 2026, kdy se novým akcionářem stal správce fondu Wilfried Reinhard Elbs.
Tím ale neskončily otázky týkající se dříve vyplacených dotací.
Do případu vstoupil Úřad evropského veřejného žalobce, který řeší podezření na trestnou činnost poškozující finanční zájmy Evropské unie. EPPO následně řešil také otázku, zda má být část věci týkající se národního spolufinancování předána českým orgánům.
Právě zde vznikl kompetenční spor, který muselo vyřešit Nejvyšší státní zastupitelství.
Verdikt: případ zůstane celý u EPPO
Nejvyšší státní zastupitelství 17. srpna 2026 rozhodlo, že se vyšetřovaná věc dělit nebude. Evropská i národní část financování zůstane v rámci tohoto konkrétního případu pod působností EPPO.
Podle NSZ by rozdělení věci mezi evropské a české orgány nebylo v daném případě vhodné vzhledem k souvislostem jednotlivých skutkových okolností a potřebě jejich společného objasnění.
Mluvčí Nejvyššího státního zastupitelství Petr Malý uvedl, že při rozhodování bylo zohledněno také evropské právo, interní pravidla EPPO a česká právní úprava společného trestního řízení.
Rozhodnutí NSZ je v rámci tohoto kompetenčního sporu konečné. Neznamená však, že tím bylo rozhodnuto o vině či nevině kteréhokoli člověka nebo společnosti. Samotné vyšetřování pokračuje.
Proč je důležité, že se případ nebude dělit?
Dotační projekty mohou být financovány z více zdrojů. Část peněz může pocházet z evropských fondů a část představovat české spolufinancování.
V takové situaci může být obtížné oddělit jednotlivé skutečnosti, které jsou předmětem prověřování. Pokud se stejné jednání týká evropské i národní části financování, mohou být pro jeho objasnění důležité stejné dokumenty, výpovědi nebo znalecké posudky.
Právě z těchto důvodů NSZ dospělo k závěru, že v tomto konkrétním případě není namístě věc rozdělovat mezi evropské a české orgány.
Neznamená to ale, že každý dotační projekt financovaný z evropských i českých peněz musí být vždy automaticky vyšetřován pouze EPPO. Jde o rozhodnutí vztahující se ke konkrétní kauze Agrofertu a jejím skutkovým souvislostem.
Co se vlastně vyšetřuje?
Samotné rozhodnutí o příslušnosti neříká, že Agrofert nebo konkrétní lidé spáchali trestný čin. Vyšetřování má teprve objasnit, zda k trestné činnosti vůbec došlo.
Podle dostupných informací se prověřují podezření související s možným poškozením finančních zájmů Evropské unie, zneužitím pravomoci úřední osoby a porušením povinnosti při správě cizího majetku.
Pozornost se zaměřuje také na okolnosti, za kterých byly dotace poskytovány, a na postup úředníků, kteří o jejich přiznání rozhodovali.
Je však důležité zdůraznit, že samotné vyšetřování neznamená, že se podezření prokázalo. O případné trestní odpovědnosti může být rozhodnuto až na základě výsledků vyšetřování a případného následného soudního řízení.
Převod Agrofertu do svěřenského fondu případ neuzavřel
Andrej Babiš v únoru 2026 převedl akcie Agrofertu do RSVP Trust. Podle jeho vyjádření tím vyřešil otázku svého střetu zájmů.
Samotný převod akcií ale automaticky neznamená, že tím skončily všechny otázky spojené s dříve vyplacenými dotacemi. Právě okolnosti poskytování dotací jsou nyní předmětem probíhajícího vyšetřování.
Důležitým mezníkem bylo také rozhodnutí Státního zemědělského intervenčního fondu (SZIF) z dubna 2026. Fond tehdy na základě právních posouzení dospěl k závěru, že RSVP Trust splňuje podmínky podle české i evropské legislativy a že neexistuje právní důvod pro vyloučení Agrofertu z čerpání dotací SZIF nebo z veřejných zakázek.
To ale řeší jinou otázku než trestní vyšetřování. Posouzení střetu zájmů a vyšetřování možného trestného činu nejsou totožné procesy.
Agrofert zůstává významnou součástí české ekonomiky
Agrofert patří mezi největší podnikatelské skupiny v České republice. Podle údajů samotného koncernu zaměstnával v roce 2025 přibližně 28 000 lidí a dosáhl konsolidovaných tržeb přes 212 miliard korun. Konsolidovaný zisk činil přibližně 2,2 miliardy korun.
Právě rozsah skupiny a objem veřejných prostředků, které mohou být s jejími podniky spojeny, dávají případu značnou společenskou i politickou váhu.
Je ale potřeba oddělovat ekonomickou velikost Agrofertu od otázky případné trestní odpovědnosti. O tom, zda došlo k porušení zákona, musí rozhodnout výsledky vyšetřování a případně soud.
Co bude následovat?
Rozhodnutím Nejvyššího státního zastupitelství nyní odpadla jedna z důležitých procesních otázek. Je jasné, že vyšetřovaná věc se nebude dělit mezi EPPO a české státní zastupitelství.
Další vývoj tak bude záviset především na samotném vyšetřování. Evropský veřejný žalobce bude pokračovat ve shromažďování důkazů a vyhodnocování okolností, za kterých byly dotace poskytovány.
V této fázi proto nelze říci, jak vyšetřování skončí. Může vést k odložení věci, ale také k dalším procesním krokům, pokud vyšetřovatelé zjistí dostatek důkazů o trestné činnosti.
Konečné rozhodnutí, ale nikoli konec kauzy
Rozhodnutí ze 17. srpna je konečné pouze z hlediska kompetenčního sporu o to, kdo má případ vyšetřovat. Samotná kauza tím rozhodně nekončí.
Právě naopak. Nyní bude zásadní zjistit, zda při poskytování dotací skutečně došlo k porušení zákona a zda za případné pochybení nese někdo trestní odpovědnost.
Jedno je však po rozhodnutí Nejvyššího státního zastupitelství jasné: vyšetřování této části kauzy Agrofert zůstává v rukou evropského veřejného žalobce a nebude rozděleno mezi evropské a české orgány.